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中心是全供事业单位,设置办公、人事保卫等公共科室4个,业务科室9个,具体包括:公卫监测科、传染病科、寄生虫病科、免疫规划科、性艾防治科、地方病科、职业病防治科、卫生检测检验中心和健教与慢性病防治所。南阳市疾控中心肩负着全市1050多万人口的疾病预防控制工作,特别是作为国家“南水北调”中线工程的水源地,是河南省水质监测工作的重点地区。承担着国家、省食品污染及有害因素监测、食源性疾病监测等检测任务,是河南省食品安全风险监测网络重点实验室。病源实验室承担着全市各种常规、突发、新发传染病检测。目前中心实验室建筑总面积2610平方米,包括理化实验室870平方米,微生物与流病实验室1740平方米,占单位建设总面积30.4%;中心现有万级洁净实验室2个,共40平方米,二级生物安全实验室(BSL-2) 5个,共240平方米,PCR实验室(4个分区)1套共80平方米。
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