医院是集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体的大型综合性教学医院，为国家卫生应急医疗移动救治中心和安徽省紧急医疗救治基地。医院前身为上海东南医学院附属东南医院，创办于1926年。1993年成为卫生部首批三级甲等医院。医院坚持科教兴院战略，银屑病的遗传学研究和红斑狼疮基因研究处于国际领先水平。医院拥有安徽省首台达芬奇手术机器人，目前机器人手术已经在泌尿外科、普外科、妇产科、心脏大血管外科广泛应用，处于国内领先水平。新增合肥市首台骨科机器人，机器人家族不断壮大。3D腹腔镜手术技术、辅助生殖技术、体外循环和心脏不停跳冠脉搭桥、心脑血管介入治疗、胸腔镜和腹腔镜微创手术、自体、异体造血干细胞移植、小儿先心病介入治疗、小儿脑瘫的康复治疗、电子耳蜗技术、中西医结合治疗肿瘤等专业技术水平达到国内先进水平。在肝肾联合移植、婴幼儿肾脏捐献移植等复杂器官移植领域，取得了积极成效，达到国内领先水平；在中西医结合治疗大面积烧伤、微粒皮移植、角膜移植术、颅底肿瘤临床手术和立体定向放射外科等方面积累了丰富的经验,处省内领先地位。