医院前身为1936年成立的高邮县戒烟所，现已发展为一所集医疗、教学、科研、急救、康复、保健为一体的三级乙等综合性医院。医院原址位于城区西部府前街116号，毗邻京杭大运河。2022年1月8日新院区正式启用，1月24日医院顺利完成整体搬迁并正式对外开放。新院区位于城区东部东园路与通湖路交汇处，占地126亩，建设有20层综合病房楼、4层门诊综合楼、5层传染病治疗中心、11层精神病治疗中心、6层行政办公教学楼，总建筑面积20余万㎡，规划设计床位1763张，目前开放床位900张。医院环境优美，流程合理，为一座花园式、现代化医院。医院科室齐全，专科力量雄厚，拥有内、外、妇、儿、感染、肿瘤、康复等一级临床科室14个，医技科室8个，病区20个，职能科室15个，心血管内科、普外科、泌尿外科、神经内科、口腔科、呼吸内科、麻醉科、妇产科、儿科、消化内科、骨科、医学检验科、神经外科、医学影像科、重症医学科、肾内科16个科室为扬州市临床重点专科。