医院成立于1988年（前身包头市工人医院）兼有包头市中蒙医研究所的建制和职责。1994年，被国家中医药管理局评为“三级乙等”医院，成为自治区民族医院中获此殊誉的首家医院。2013年成功创建国家级民族医“三级甲等”综合医院。现如今已发展成自治区西部区最大的一所以蒙医、中医为主体，蒙、中、西医并存，集医疗、教学、科研为一体的民族医“三级甲等”综合医院。医院分东河院和滨河院两个院址，总占地面积7.2万平米，建筑面积4.2万平米。全院床位编制900张，实际开放床位704张。全院设有33个临床科室、25个护理单元、11个医技科室，拥有国家级重点专科4个（脾胃病科、肝病科、蒙医护理、治未病中心），自治区临床重点专科2个（蒙医康复科、治未病中心），自治区临床重点学科1个（蒙医针灸推拿科），自治区特色优势专科5个（蒙医疗术科、蒙医康复科、治未病中心、蒙医皮肤科、中医针灸推拿科），包头市领先学科和重点专科各1个（蒙医内科、蒙医疗术科）。