中心是科技部、财政部正式认定的中国空间科学领域唯一的国家科学数据中心，属于基础支撑与条件保障类国家科技创新基地。数据中心以中科院国家空间科学中心为依托单位，联合中科院国家天文台（探月工程中心）、中国科学技术大学、中科院国家授时中心和中科院计算机网络信息中心等单位共同建设和运行。数据中心是北京怀柔综合性国家科学中心空间科学实验室的重要组成部分，是世界数据系统（WDS）的正式成员，是被美国地球物理学会（AGU）认可的学术论文关联数据仓储库。国家空间科学数据中心的使命是推动空间科学领域数据资源的有序汇交、规范管理和开放共享，保障科学数据安全，发展自主可控的科学数据创新应用生态系统，促进数据驱动的科学研究范式的形成，极力提升科学数据的高效利用。发展愿景是建立国际一流的科学数据中心，成为我国空间科学领域的重要科技基础设施和交叉人才高地，为我国科学技术创新、经济社会发展和航天强国建设提供有力支撑。