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上海市农业科学院成立于1960年，现已发展成为一个学科较齐全、设备先进、学术水平较高、成果转化能力较强、为上海和全国农业发展提供强有力支撑的地方综合性农业科研机构。全院下设作物育种栽培研究所、林木果树研究所、设施园艺研究所、食用菌研究所、畜牧兽医研究所、生态环境保护研究所、农业科技信息研究所(数字农业工程与技术研究中心)、生物技术研究所、农产品质量标准与检测技术研究所、上海市农业生物基因中心等10个研究机构， 1个综合服务中心和1个综合试验站。拥有17个国家级和部级科技创新平台和成果转化平台，8个市级科技平台。馆藏各类中外书刊30余万册。
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