本院始建于1951年，前身系西南军政委员会卫生部药物食品检验所，是全国最早建立的五个省级药检所之一，是国家对食品药品实施质量监督检验的法定机构，具有独立的法律地位和第三方公正性，属于社会公益型非盈利性质事业单位。2003年被确定为中华人民共和国重庆口岸药品检验所，具备检验检测机构资质认定（CMA）和中国合格评定国家认可委员会实验室认可（CNAS）资质，检验检测能力覆盖食品、特殊食品、药品、生物制品、化妆品、食品药品包装材料、洁净环境与医疗器械等领域。本院先后被国家确定为国家药监局麻醉精神药品质量监测重点实验室、国家市场监管重点实验室（调味品监管技术）、生物制品进口口岸检验机构、血液制品批签发机构、首次化学药品进口口岸检验机构、食品复检机构、化妆品复检机构、特殊食品注册和备案检验机构及化妆品注册和备案检验机构，成立市级博士后科研工作站，获批工信部食品企业质量安全检测技术示范中心、重庆市化学药品质量控制与评价协同创新中心以及重庆市调味品质量安全工程技术中心等科研平台。拥有由国家药典委员、国家级和省级药品注册及生产检查员、食品和化妆品生产检查员等59人组成的专家团队。拥有气质、液质、ICP-MS 、生物质谱和基因测序等仪器设备2900余台套，原值约2.8亿元。通过资质认定参数3000余项，实验室认可参数1300余项。年检检品量可达80000批次以上。独立承担全球基金和世界卫生组织（WTO）国际药典药品标准研究项目，牵头科技部食品安全社会共治重点研发计划项目。近五年，共承担省部级以上科研课题100余项。本院秉持“科学、公正、准确、高效”的方针，以完善的基础设施、先进的仪器设备、科学的质量体系和卓越的技术能力，优质高效开展上级政府部门下达的指令性检验、政府部门的稽查检验与应急检验、公众委托检验和科研合作项目，竭诚为行政监管、产业发展和公众需求提供高质量的技术支撑、支持和服务。